MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl23

Total Repeats: 740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011252	TAA	2	6	20	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011252	AGA	2	6	62	67	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011252	TCT	2	6	68	73	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011252	AAAG	2	8	77	84	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011252	CTG	2	6	87	92	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011252	TGT	2	6	106	111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011252	T	6	6	132	137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011252	TAT	2	6	147	152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011252	AAC	2	6	155	160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011252	T	9	9	212	220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011252	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011252	ATT	2	6	238	243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011252	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011252	ATA	2	6	288	293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011252	TA	4	8	300	307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011252	CAT	2	6	310	315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011252	GA	3	6	347	352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011252	AAC	2	6	355	360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011252	ATT	2	6	380	385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011252	TAT	3	9	413	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011252	AAT	2	6	423	428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011252	AT	3	6	433	438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011252	CAT	2	6	446	451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011252	TAT	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011252	TAT	2	6	471	476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011252	AACAA	2	10	490	499	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011252	A	6	6	603	608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011252	TTAA	2	8	629	636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011252	ATCC	2	8	688	695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011252	CAC	2	6	704	709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_011252	T	6	6	719	724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011252	T	7	7	726	732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011252	ATCA	2	8	743	750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011252	TAA	2	6	838	843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011252	TTA	2	6	913	918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011252	TATAAA	2	12	957	968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011252	ATTAA	2	10	997	1006	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011252	TAT	3	9	1028	1036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011252	AT	4	8	1035	1042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011252	T	6	6	1059	1064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011252	AT	3	6	1065	1070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011252	ATTA	2	8	1110	1117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011252	ATT	2	6	1126	1131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011252	TTG	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011252	TAA	2	6	1221	1226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011252	T	7	7	1237	1243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011252	TAA	2	6	1270	1275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011252	ACA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011252	TCA	2	6	1333	1338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011252	TAA	2	6	1347	1352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011252	A	7	7	1370	1376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011252	A	7	7	1423	1429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011252	ATT	2	6	1470	1475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011252	CATA	2	8	1491	1498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011252	CAAA	2	8	1510	1517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011252	T	7	7	1539	1545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011252	GAA	2	6	1546	1551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011252	CATA	2	8	1583	1590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011252	CAG	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011252	ATTA	2	8	1623	1630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011252	AAC	2	6	1638	1643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011252	CAA	2	6	1646	1651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011252	GTT	2	6	1718	1723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011252	AAT	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011252	CAA	2	6	1790	1795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011252	TAT	2	6	1796	1801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011252	AAG	2	6	1929	1934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011252	TAA	2	6	1967	1972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011252	ATC	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011252	CAT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011252	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011252	ACA	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011252	AAT	2	6	2206	2211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011252	CAT	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011252	TCC	2	6	2243	2248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011252	ACA	2	6	2272	2277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011252	AAT	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011252	TAC	2	6	2310	2315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011252	A	7	7	2330	2336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011252	TA	3	6	2351	2356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011252	TA	3	6	2373	2378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011252	AT	3	6	2380	2385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011252	AAATT	2	10	2394	2403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011252	AT	3	6	2409	2414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011252	ATT	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011252	TAA	2	6	2477	2482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011252	ATA	2	6	2498	2503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011252	CAT	2	6	2551	2556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011252	ATG	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011252	TC	3	6	2607	2612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011252	ATCCC	2	10	2644	2653	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
92	NC_011252	C	6	6	2664	2669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_011252	ATA	2	6	2682	2687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011252	TTACC	2	10	2692	2701	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_011252	AGC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011252	ATC	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011252	GCA	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011252	ACC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011252	ATG	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011252	CAT	2	6	3010	3015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011252	TTG	2	6	3058	3063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011252	CTT	2	6	3133	3138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011252	TAG	2	6	3214	3219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011252	CAA	3	9	3238	3246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011252	TTC	2	6	3274	3279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011252	TCAT	2	8	3335	3342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011252	TTA	2	6	3402	3407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011252	TCA	2	6	3428	3433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011252	TAAA	2	8	3462	3469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011252	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011252	TAAT	2	8	3510	3517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011252	T	6	6	3517	3522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011252	TAT	2	6	3546	3551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011252	TTA	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011252	TAA	2	6	3690	3695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011252	GAT	2	6	3717	3722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011252	A	6	6	3854	3859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011252	AT	4	8	3871	3878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011252	GAT	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011252	CAT	2	6	3948	3953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011252	CTT	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011252	ATT	2	6	3990	3995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011252	ATT	2	6	4019	4024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011252	TCG	2	6	4034	4039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011252	AGA	2	6	4050	4055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011252	AC	3	6	4065	4070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011252	ATTA	2	8	4092	4099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011252	TGA	2	6	4104	4109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011252	A	6	6	4120	4125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011252	AC	3	6	4174	4179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011252	TATAA	2	10	4271	4280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011252	ATT	2	6	4281	4286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011252	ATCTT	2	10	4336	4345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_011252	TAT	2	6	4359	4364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011252	TAA	2	6	4479	4484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011252	TCC	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_011252	ATG	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011252	T	6	6	4537	4542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011252	AC	3	6	4552	4557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011252	A	6	6	4585	4590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011252	TAAT	2	8	4591	4598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011252	AAT	2	6	4659	4664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011252	ATT	2	6	4693	4698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011252	TTA	2	6	4704	4709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011252	ATTCA	2	10	4720	4729	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011252	AAC	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011252	ACT	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011252	ACA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011252	A	7	7	4815	4821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011252	CAA	2	6	4822	4827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_011252	TAT	2	6	4848	4853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011252	TAAT	2	8	4892	4899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011252	TAA	2	6	4931	4936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011252	A	7	7	4935	4941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011252	TTA	2	6	4943	4948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011252	AAT	2	6	4954	4959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011252	ATA	2	6	4999	5004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011252	A	7	7	5004	5010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011252	ATCA	2	8	5036	5043	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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165	NC_011252	CTATA	2	10	5225	5234	40 %	40 %	0 %	20 %	203288365
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173	NC_011252	A	6	6	5388	5393	100 %	0 %	0 %	0 %	203288365
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332	NC_011252	AATT	2	8	10280	10287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_011252	TAAA	2	8	13535	13542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_011252	ATT	2	6	14561	14566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288373
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464	NC_011252	TTC	2	6	14864	14869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288373
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470	NC_011252	TAT	2	6	14984	14989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_011252	AT	3	6	14988	14993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_011252	AAATTA	2	12	14994	15005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_011252	TAT	2	6	15018	15023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288374
474	NC_011252	TC	3	6	15032	15037	0 %	50 %	0 %	50 %	203288374
475	NC_011252	ATA	3	9	15053	15061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288374
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494	NC_011252	TTATC	2	10	15687	15696	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_011252	TAT	2	6	15837	15842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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